早春和初夏阴雨连绵、高温、高湿、昼暖夜凉的天气有利发病，种植地低洼积水，田间郁闭高湿，茎节受蝼蛄为害伤口多，或施用未充分腐熟的土杂肥，会加重辣椒根腐病病情。连作地、低洼地、粘土地发病重。
药剂防治
（1）喷洒或浇灌50%甲基硫菌灵硫磺悬乳剂800倍液；
（2）或50%根腐灵可湿性粉剂800倍液；
（3）或50%杀菌王水溶性粉剂1000倍液
（4）或50%多菌灵可湿性粉剂500倍液
（5）或50%地灵可湿性粉剂800倍液
（6）或50%甲基托布津可湿性粉剂500倍液
（7）或10%双效灵水剂200~300倍液
（8）或75%敌克松可湿性粉剂800倍液
（9）或40%混杀硫胶悬剂500倍液，每667平方米喷药液50升，隔10天左右1次，连续2~3次。采果前3天停止用药。
辣椒生长期长，根系弱，为使其不断开花结果，必须有良好的土壤条件和营养条件，定植前翻地10~15cm深。亩施厩肥5000kg，可掺施过磷酸钙15kg~20kg，短灌、短排作沟渠，沟沟相通，使雨后田间不积水。
