选用抗病品种。与玉米、谷子、甘薯等非寄主作物轮作。播种时增施农家肥、钾肥、磷肥等。在播种时施根施通配合杀菌剂进行灌根，使大豆根吸收可防止根部侵染。
播种前用种子新高脂膜浸种，浸种后捞出晾干即可下种。可保温、保湿、吸胀，提高种子发芽率，使幼苗健壮。驱避地下虫害，隔离病毒感染。也可与种衣剂混用。
加强田间管理，及时深耕及中耕培土除草，雨后及时排除积水，防止湿度太大。发现病株及时拨出，彻底清除病株残体，并在病株栽植穴及四周喷施护树大将军消毒，杀菌。该病发生后，很难治愈，应以预防为主。预防可选用根施通与护树大将军配合灌根，能诱导病毒集结，抑制大豆根部病毒传导式感染及叶片和果实，保养植株输导系统健康工作。
