1.品种老化.抗病性减弱，故选用抗病品种是经济有效的措施之一。
2.温度过低.是诱发丝黑穗病的重要因素，故早春播种时避开低温或提前覆盖地膜，提高地温，或在病害形成黑粉瘤未破裂时，及时摘除瘤体并适时深埋，减少病菌在田间扩散，降低病菌侵染机率。
3.玉米丝黑穗病主要是由土壤传播.实行3—5年以上轮作，降低土壤中的含菌量，施用的土杂肥应充分发酵，降低病菌含量。
4.合理密植.加强田间管理，促进植株生长健壮，增强其抗病害能力。总之，利用抗病品种，有选择性的使用种衣剂和提高播种质量，加强田间管理就可以有效地控制玉米丝黑穗病的发生与危害。
5.药剂使用不当.正确选用种衣剂能够有效地降低玉米丝黑穗病的为害，防效一般可达80%以上。但由于目前玉米种衣剂种类繁杂，大多数不含有对丝黑穗病具有防治作用的杀菌剂成分，而农民在选择时往往只注重价格而盲目购买。
6.栽培地点差异。同一品种、同一管理水平，栽种在不同地点，其发病程度不一。种植在平地、沟地、低洼地等墒情较好的地块发病率10%～15%，坡地等墒情较差地块发病率30%～40%。
