大棚辣椒沤根病在苗床或定植后的幼苗均有可能染病，发病时秧苗幼根表面呈锈褐色，后逐渐腐烂，新根不发，导致地上茎叶变黄，植株萎蔫而死，是一种生理病害。辣椒沤根病非病菌侵染所致，主要是浇水过多、通风不够、地温长期低于12℃、土壤通气不良引发。
防治措施
在管理上应“对症下药”，加强苗床温度管理，有条件者采用温床育苗，注意加大通风量，减少棚内湿度，同时配合喷施新高脂膜800倍液形成保护膜，防止气传性病菌侵入；畦面整平，严禁大水漫灌，浇后及时中耕，避免过早过深地进行根际培土，并在辣椒定植后及时喷施新高脂膜800倍液可有效防止地上水分不蒸发，苗体水分不蒸腾，隔绝病虫害，缩短缓苗期，使植株快速适应新环境，健康成长；尽量避免用杀菌剂之类的农药进行大量喷洒，否则会加重沤根；发生轻微沤根者，应及时划锄松土、提高地温，增强土壤透性。
