一、适时收获：母本(即杂交种子)籽粒充分成熟时收获。在收获前，还要进行一次田检，清除异株、劣株、病株和可疑株，保证杂交种完全成熟后及时收获。
二、及时通风晾晒：收获后及时通风凉晒，可将果穗用苞叶编成串挂起晾干，但要保持通风良好，以防霉烂及虫害。
三、进行穗选、粒选：脱粒前必须进行一次穗选，按穗型、粒型、粒色，除去杂劣、病穗、霉烂穗和不成熟的果穗，再进行粒选，剔除杂、劣粒，确保种子净度和纯度。果穗子粒含水量降低到16%—18%时才能脱粒。脱粒后立即晾晒，待含水量下降到13%以下时方可交售。
四、防止混杂：制种果穗从收获、运输、翻晒、脱粒、交售等全过程要和其他品种、父本籽粒或商品玉米严格分开，防止机械或人为混杂，确保种子质量。
