1、遵守检疫规定，严禁将带有黄瓜绿斑驳花叶病毒的葫芦科植物种子、种苗、接穗、砧木和其他繁殖材料调往未发生区。
2、种子处理，将可能染病的干种子放在70℃下干热处理72小时，可钝化病毒，是防止病毒病传播的有效方法。药剂处理。无论是西瓜或砧木的种子都必须进行种子消毒处理。干热处理后种子放置室内待自然回潮后,再浸入药剂处理以10%-20%磷酸三钠浸种20分钟，清水洗净后播种。
3、利用溴甲烷等进行土壤熏蒸消毒处理发病田块。
4、嫁接时选择健康砧木或接穗。嫁接时工具要注意消毒，避免接触传染。
5、拔除病株。在种子出苗后发现花叶或畸形病株，立即拔除并集中销毁，不能随意丢弃。
6、发生田块需种植非葫芦科作物进行2-3年的轮作倒茬。
7、加强田间管理。田间做好排水管理，防治病毒传播，增施肥料，促进植株生长，增强抵抗力，尽量减轻损失。收获后清理田间病残枝叶并集中销毁。
