辣椒是需肥量较大的作物。据研究，生产2000公斤辣椒需要吸收氮10.38～11.60公斤，磷1.16～2.20公斤，钾12.92～14.80公斤。试验证明，对辣椒施肥应适量多施氮，其次是钾，磷可少施。氮多、钾中、磷少的施肥方案，比氮磷钾等比的增产24.9%，比氮中、磷少、钾多的增产26.8%。
要获得辣椒高产，建议一般每亩施氮磷钾复合肥50～60公斤，钙镁磷肥50公斤左右，尿素15～25公斤，硫酸钾或氯化钾10～20公斤（或草木灰200公斤）。具体施肥量依据土壤肥力增减。其中钙镁磷肥迟效，在土壤中移动性差，又易被土壤固定，应全部作基肥，并集中沟施。尿素易烧根又容易流失只能少量（一般5公斤/亩）作基肥。钾肥也容易流失，而且辣椒结果期大量吸收钾，钾肥可促进果实膨大，所以钾肥主要在结果期作追肥用。复合肥多用做基肥。如果是地膜覆盖栽培，总量的80%以上作基肥；不盖地膜的保肥性好的黏性土50%～60%作基肥，漏肥的沙性土30%～40%作基肥。
除氮磷钾外，辣椒还需要多种营养元素。施用农家肥效果较好，没有农家肥的，可购买生物有机肥。如果完全用化肥种辣椒，除常规施肥外，还需叶面喷肥，主要是补充它需要的硼、锌、铁、铜等微量元素。
