节瓜的主要病害是疫病和炭疽病。疫病能侵害茎、叶和果实，以蔓茎基部发病较多。幼苗近地面茎基部发病时，初呈暗绿色水渍状，病部缢缩，其上部的叶片逐渐枯萎，最后全株死亡；节部被害而缢缩，造成枝叶枯萎；叶部被害，产生水渍状近圆形大斑，湿度大时，病斑迅速扩展至全叶而腐烂；果实被害呈下凹水渍状斑块，并很快扩展至全果而呈软腐状，表面长出稀薄的白色霉状物。对疫病的防治要采取综合防治措施。具体方法是：
（1）对种子和土壤进行消毒：种子可用150倍的福尔马林浸种30分钟，洗净后再催芽播种；土壤可用95%敌克松或80%代森锌1000倍液淋施，每平方米用2.5公斤药液。
（2）合理轮作，加强肥水管理。
（3）发现病株及时拔除，集中烧毁，并在病穴撒石灰消毒。
（4）药剂防治：必须注意适时、适法，预防为主，宜早不宜迟。因此，在齐苗后，子叶平展时，即应检查田间病害发生情况，以利于适时施药。一般可用58%瑞毒锰锌、64%杀毒矾、70%乙锰600倍液或90%乙磷铝300～400倍液，隔5～7天1次，连喷3～4次。
炭疽病症状与苦瓜的症状近似，可用80%代森锌800倍、70%甲基托布津1000倍、75%百菌清800倍、50%施保功1500～2000倍、6.5%利枯灭1000倍，每隔7天左右1次，连喷3～4次，效果良好。
