秧苗立枯病常发生在秧苗1.5叶-2.5叶期，有青枯、黄枯等类型。青枯常急性发生，叶片卷成针状，叶色灰绿，很快枯死，死苗青灰色，极易在低温阴雨后初晴的上午大量发生，成片枯死。黄枯最初表现为中午卷叶，叶片逐渐枯黄，根系变褐，白根少，茎变褐甚至腐朽，常成族、成片枯死，有明显的发病中心，逐渐向外扩展。该病害有传染性，病原菌主要是腐霉病。防治措施：
1、选好苗床。苗床应选择地势向阳爽水，土壤蔬松肥沃，土层较深厚的地段，以适应旱育秧控水旱育的特点。
2、抓好床土调酸与消毒。水稻幼苗适于在pH值4.5-5.5酸性土壤条件下生长，pH值大于6.5时，幼苗生长受到抑制，而且遇低温时易感立枯病。早稻和早播中稻一般都要进行调酸与消毒处理。目前生产上主要使用壮秧剂进行床土调酸和消毒。1平方米功米苗床施壮秧剂60克-120克，施后均匀翻拌于10厘米的土层中即可。
3、适度催芽，保护好种根。为使种根在播种时不受折损，发挥种根在幼苗期的重要生理作用，旱育秧催芽的程度以破胸为度，要求播后压种，使谷种三面入泥，盖种厚0.5厘米-1厘米，使种根能顺利生长和下扎。
4、科学管理苗床。播种至1.1叶保湿保温促出苗，苗床湿度以厢面厢沟不积水为度，膜内温度控制在32℃-35℃，实现出苗快又齐。1.1叶至2.1叶期适当揭膜通风降湿促扎根，膜内温度控制在22℃-28℃，秧苗不卷叶不浇水，促使种根及芽鞘节根的生长和下扎，防止叶片生长过旺。1平方米苗床用70%敌克松粉剂2.5克对水1.5公斤或用20%甲基立枯灵1克对水1公斤喷雾，防治立枯病。2.1叶后种根的系根及不完全叶节根已形成，苗床实行湿润管理，多次追施腐熟的稀薄人粪尿或沼液促分蘖，并注意揭膜炼苗和低温时盖膜护苗，使秧苗逐渐适应外界环境。低温阴雨过后初晴的早上太阳刚出现时，要逐厢仔细检查秧苗的生长情况，如发现有秧苗叶尖不吐水或秧苗有异样时，应立即用70%敌克松粉剂500倍液或硫酸铵进行喷雾，并注意保持床土湿度，以有效防止立枯病的危害。
