干热消毒法对温度忍耐力强的种子，可用干热法进行消毒。如番茄种子精选后，经充分晾晒，使其含水量降至７％以下，再放入烘箱内慢慢升温到70℃左右，4天后播种，可防治番茄溃疡病、病毒病等。
热水浸种消毒法适合于表皮比较坚硬的种子，如菠菜、茄子、黄瓜等，能耐较高的温度。将种子放在70℃的热水中搅拌，水温降至30℃时停止搅拌，然后按不同种子所需的浸种时间浸种，晾干后播种。此法能杀死部分种子表面携带的病菌。
药液消毒法用40%福尔马林100倍液浸种30分钟，浸后用清水洗净，晾干播种，可防治炭疽病、枯萎病。用10%磷酸三钠的0.5%倍液，或用2%氢氧化钠溶液，浸种20分钟，可防治病毒病。用1%硫酸铜溶液浸种5分钟，可防治细菌性斑点病、炭疽病。
药粉拌种消毒法用福美双、克菌丹、百菌清等农药的可湿性粉剂，用量为种子量的0.3%，可防治猝倒病。种子浸泡后再用药粉拌种，直播。
