1.防雨淋。秋冬辣椒栽培，从播种育苗到采摘上市的全过程，都必须在大棚内进行，避免风吹雨打。2.防暴晒。秋冬辣椒从播种到9月25日前，棚膜上面必须加盖遮阳网，以降低光照强度，防止烈日直接暴晒。为防止长期覆盖遮阳网造成辣椒徒长，阴天要撤下遮阳网；晴天上午8时以前和下午5时后，气湿较低，光照较弱，遮阳网也应撤下，使棚内辣椒有充足的光照；随着气温和光照逐渐降低和减弱，盖网时间也应逐渐缩短。3.防酷热。秋冬辣椒从播种到始花(9月中下旬)期间，正处酷暑炎热天气，白天多数时间气温在35℃以上，田间中午气温可高达40℃以上，对辣椒生长结果极为不利。此时应设法降低棚内气温，白天和晚上，要尽量通风，晚上遮阳网要揭下，使辣椒尽量受露；浇水安排在早上或傍晚进行，并尽可能用冷凉的河水或井水浇泼，以利降低田间和土壤温度，切忌高温热水浇灌。4.防寒潮。10月下旬以后当夜温降至12℃以下时，大棚内要架设小拱棚，大棚膜白天两头开口通风，夜间要放下盖严，使棚内温度白天维持在25℃左右，夜间不低于12℃，以利坐果和果实膨大发育；11月下旬当寒潮来临和进入严冬季节后，夜间气温降至5℃以下时，小拱棚和大棚膜都要盖实盖严，白天小拱棚要迟揭早盖，以利每天见光；要控制浇水，以防湿度过大造成冻害。实践证明，采用双层覆盖，只要辣椒不直接受到霜冻，完全可以越冬。
5.防病虫害。影响秋冬辣椒的主要病害是病毒病，在秋冬辣椒的栽培过程中，要及时使用植物细胞免疫因子，提升抗逆性，可使病毒DNA断裂凋亡。强大免疫功能，诱生干扰素和活性细胞介素，抑制残余病毒复制，促进植物正能量生态生长。以寄主植物抗病机理及利用病菌毒性变异原理，控制植物生理性病害和侵染性病害繁衍。
