采用物种多样性防治条锈病：目前，采用物种多样性防治新方法，对小麦条锈病的防治也收到了一定成效。
物种多样性等于多个小麦品种的混播，是对相同季节里生长的多种作物而言，比如与小麦能同季节里生长的有蚕豆、油茶、大蒜、马铃薯、蔬菜、药材等。也就是说利用自然界共生的多种作物，来达到控制小麦条锈病大发生的目的。其原理是对条锈菌具有的特殊传播方式（高空远距离传播）进行阻断来达到控制小麦接受外来菌量的目的，并降低发病程度及再传播的机会。
药剂防治：目前市面上药剂种类很多，有特效的百理通，粉锈灵等。但在实际操作上还应重视：（1）加强对农技干部的培训，正确使用对路药剂种类和使用方法。（2）要求条锈病菌源越夏、越冬的关键地区，播前必须进行药剂拌种，加强冬季早防早治。（3）在冬前条锈病发生早的地区及其周边地区，春后必须用药防治，确保小麦后期正常生长，减少产量损失。
