一、木瓜基肥
广州地区春植木瓜一般在2月下旬至3月上旬，基肥应在此之前施下。建议以每亩定植200株计，每株施腐熟鸡粪5千克，过磷酸钙1千克，石灰0.5千克，与土混合后施于植穴。鸽粪、猪粪、EM生物有机肥（有效微生物有机肥），也可作木瓜的基肥，营养成分高，肥效较持久。
二、木瓜促长追肥
木瓜在定植后的3、4月份，是促进木瓜快速生长和提早开花的关键时期。在此时期木瓜苗嫩根浅生，施肥宜由薄渐浓，由少至多，以氮为主，每10天施1次共施5次。在木瓜定植后10~15天，叶片正常伸展后，每株施尿素10克，撒施或对水淋施；再过约10天追施第二次，每株施尿素10克；此后每约10天追施第三、第四和第五次肥，每株尿素20克、30克和30克。在此时期结合喷杀菌剂每7~10天叶面喷0.2%~0.3%的尿素液或憐酸二氢钾液，两者交替喷施更好。
三、木瓜促花追肥
木瓜在定植后生出一定叶片数后便出现花蕾。如广州地区，早熟木瓜品种一般在24~26片叶时现蕾（定植后约50天)。木瓜在现蕾前后要增加施肥量特别是鱗和钾。建议在5月上旬每株追施复合肥（氮：磷：钾=15:15:15）100克，5月下旬再追施同量复合肥，以维持植株生势强壮，花芽分化良好。为预防木瓜缺硼症发生，每株配施硼砂5克，或硼酸3克，同时结合喷药或单独叶面喷施0.2%的硼酸或0.3%的硼砂液每周1次共4~5次。
四、木瓜盛果期追肥
在6月至10月是木瓜继续生长、大量开花坐果时期，需多量肥料以满足下部果实发育和上部继续开花坐果的需要。建议在6月上旬及下旬各施1次复合肥，每次每株100克；7、8、9、10月各施1次复合肥，每次每株150克，8月加施腐熟的花生麸肥，每株500克，以便提高果实品质。
在冬季温度较高的雷州半岛和海南岛等地，果实可继续发育、成熟，11、12月及早春，应继续施肥，并配合淋水灌水，满足果实发育的需要，以生产冬、春木瓜供应市场，获得更佳的经济效益。
以上是以春植木瓜为产4000千克的施肥时期及施用量为例，若其他季节种植，按照其生长、开花和结果进程的相应时期施用。一般小果型木瓜产量较低，肥料施用量可酌减，但更要强调鱗、钙、钾、有机质肥和微量元素硼的施用，以提高果实品质。
在木瓜施肥上，要坚持有机质肥与化学肥料结合；长效肥料与速效肥料结合；土壤施肥与叶面施肥结合。由于种植密度大，中后期根系已布满植地，应尽量少用沟施、穴施；为减少伤根和省工，施肥次数还可适当减少。有益微生物有机肥的施用效果良好，要积极推广。
