一、种子质量差。过期种子或种子质量没有达标的，其种胚多数无生命力，发芽率低，即便有些能够发芽，发芽势也弱，如果误播了这样的种子，往往造成缺苗断垄。
二、种子处理方法不当。玉米种子进行种衣剂处理时，处理不当，也会造成出苗率降低。如100千克种子使用烯哩醇（有效成分）超过10克，会产生药害。如果使用种衣剂的浓度过高，会因表面浓厚的药剂，造成种皮内氧气不足，抑制种子发芽，严重时种胚坏死，播种后不易出苗。
三、发芽时温度不适宜。如果种子发芽的温度过低，会影响玉米种子的发芽率，甚至出现种子发霉、腐烂等现象，从而降低种子的出苗率。
四、播种水平差。播种过深、过浅或墒情控制不当，有的出苗早，有的出苗迟，出苗迟的易成为弱株。种子播种过深，出苗时间长，消耗养分多，幼苗生长不出来，或出苗后苗瘦弱；播种过浅，容易落干，种子不能正常吸水，出苗不全。土壤田间持水量过大，地温降低，会沤烂种子和幼苗刚发出来的根，降低种子的发芽和出苗。
五、地下害虫危害。播种后，地下害虫在土层中活动频繁，咬食种胚、胚芽及幼苗根系，也会大大降低出苗率。
