出现根部发黑、腐烂现象，基本上有如下的情况：
①柑橘根结线虫为害。柑橘线虫主要危害柑橘根部，初期地上部症状不明显，严重时才出现叶片黄化，落叶及小枝枯死的现象。柑橘根结线虫寄生在根的皮层与中柱间，使根组织不正常过度生长及形成各种大小不一的根瘤。根瘤开始为白色，以后渐变为黄褐色至黑褐色，最后根瘤与根坏死、腐烂。由于根结线虫病初发时，地上部分没有明显的症状，到病情发展，受害严重，部分根系坏死，根系总能力即吸收养分下降时，才会出现早期叶片黄化，落叶、不正常落果，新梢细弱等现象。并且沙糖桔植株与一般蔬菜类植株相比，体积相对较大，根群相对较多，根系相对扎得更深，往往难以被发现。直到根系被害过重，再无能力吸收养分对上部的支持，在高温蒸腾量过大的情况下，植株最终枯死。
②因施下未腐熟透的有机肥，长期土壤水分过多，或长期土壤排水不良，也会导致根系坏死腐烂，而植株最终死亡。建议措施：亩施15％涕灭威颗粒剂，或10％克线磷颗粒剂，或10％克线丹颗粒剂约5公斤。但需要注意上述农药属高毒农药，且持效期较长，半衰期长达40－60天。注意要在采果前3个月以上施下，施药前要进行在树冠滴水线内外约40厘米处浅松土，每株均匀撒施约60克，操作时要戴手套，避免药物与皮肤接触，施后覆土。
