小麦主要病害有锈病、白粉病。
1、锈病：以条锈（叶上孢子堆排列整齐成行）分布广，危害重，叶锈在秋麦上时有危害，小麦近成熟时，杆锈在部分品种上有发生。锈病防治应采取选用不同类型抗病品种、适时播种、合理施肥、适时灌水、铲除自生麦苗、及时施药防治等措施。11月中—12月中，田、地麦交错地区踏查地麦，1月中旬踏查田麦，发现病叶或发病中心时用15%粉锈宁0.05——0.75千克兑水喷雾控制冬前病情。小麦剑叶抽出后再施1次药防病保产。
2、白粉病：田间群体偏大，通风透光差或长势差，抗性下降均利于小麦白粉病发生。除选用抗病品种，注意氮、磷、钾肥配合施用外，孕穗末期用粉锈宁防1次或硫磺悬浮剂防2次。