西兰花抗病性较强，正常年份很少发病。但栽植过密，连续多雨，田间排水不畅，会发生黑腐病、根腐病、霜霉病等病害。
病害以防为主，除加强水份管理外，还应在生长后期剥除下部发病的叶片，改善通风透光条件。定植15天后可每隔10-15天用72.2%霜霉威600倍液，或75%百菌清500倍液等结合新高脂膜500倍液喷雾防治霜霉病。可用72%农用链霉素3000倍液，或77%可杀得可湿性粉剂1500倍液等药剂结合新高脂膜500倍液交替使用2-3次，防治根腐病。
害虫主要有菜青虫、小菜蛾、蚜虫、斜纹夜蛾等，防治菜青虫、小菜蛾可用2.5%菜喜1000倍液，或5%锐劲特1500倍液，或0.3%苦参碱3000倍液等结合新高脂膜800倍液防治。蚜虫可用10%吡虫啉2000倍液，或50%抗蚜威2000-3000倍液等防治。斜纹夜蛾可用3%抑太保2000-3000倍液防治。
