草甘膦、百草枯都是灭生性的除草剂。草甘膦在杂草受药后，其活性物质被传导到根系，阻碍了杂草根系的蛋白质合成，令根系丧失吸收水分、养分的能力而最终枯死，对禾本科杂草高效，对阔叶杂草效果差。因喷药后杂草根系中毒丧失活力，地上部位才发黄枯萎，因此从施药到杂草最终枯萎一般需要约7天以上。百草枯在杂草受药后，其活性物质马上破坏了杂草茎叶中的叶绿素而令杂草地上绿色的部位枯萎。
不论属于何种杂草都能防除，并且过程较快，一般从受药到杂草出现中毒发黑萎蔫，仅需约4个小时。根据上述两种杂草的特性，对于以生长禾本科杂草为主的柑橘类果园来说，使用草甘膦是相对较为安全的。当上述两种除草剂的药雾滴入土壤后，只要不是过量，其活性物质都会与土壤中的铁、铝离子发生化学作用而被钝化，对土壤一般的影响不大。使用何种除草剂，主要是视杂草的科属及作物的情况而定，而并非是主要考虑土壤的购成。至于用什么方法除草，这是不宜简单作出结论的。
例如，如果所种植的植株已有一定的高度，且果园中的杂草并非是深根性（如茅草）或缭绕性（牵牛花），我们的观点是尽量不用除草剂（可在杂草疯长时使用割草机，或喷洒植物生长调节剂抑制其疯长，如使用多效唑）。因为，绝大多数的杂草是一年生，即在春夏旺盛生长，到冬季枯死，其所吸收的养分最终还田，增加土壤的有机质。其二，以杂草对果园的覆盖，减少了夏季强阳光对土壤的直射，降低了土壤的温度，减少了土壤高温对根系伤害的可能性。在雨水较多的季节，能减少大雨、暴雨对土壤的冲刷而令土壤流失，又能将过多的水分帮助蒸发一部分，减少土壤过多的水分，从而减少因土壤水分过多氧含量过少而对根系的影响。再有，在干旱时，又能减少土壤水分的过分蒸发，令果园生态环境有较良性的条件。
