苹果树秋施基肥一般在中晚熟品种采果前后，宜早不宜晚，以9月中旬~10月中下旬为宜。此时气温高、雨量多，基肥有充足的时间分解，叶片功能尚未衰退，有较强的光合功能，养分回流到根中，正值果树根系生长的高峰，且断根容易愈合，并能生出大量的分生根和吸收根，有利于增加树体营养水平。
据技术人员试验数据，如果9月底采完果子马上施肥，来年3月树体氮元素含量是206份。如果采完果子后没有马上施肥，而是等到11月份再施肥，那么来年3月树体里的氮元素含量就是139份。如果秋季不施肥，来年3月的时候，树体内就仅有100份的氮元素。为了更形象地告诉果农秋季施肥的好处，山东农大姜远茂教授总结说秋施肥是金，冬施肥是银，春季施肥是糊弄人。
果农们非常关心如何合理用好有限的有机肥、使之发挥最大效果？我们一定要改变全园施用的习惯，变为集中施用。因为只有有机肥与土混合达到一定的浓度，才能发挥有机肥改土的效果。在有机肥不足时，可以集中挖穴施用，为根系提供一个局部的优化空间。
山东蓬莱市果农曲受朋的苹果园连续14年亩产1万公斤以上，管理上与别人最大的区别就在于秋季施肥管理。采完果子后，当别人正忙着卖果子或者休息时，他已开始准备施肥了。他施肥也不是传统的挖几条放射沟，而是挖穴。他种的乔化富士树体较大，每棵树挖6~8个穴，穴直径30~40厘米，深40~50厘米，将腐熟好的有机肥、化肥等与挖出的土壤充分混合均匀后回填，否则土壤局部浓度过高，易造成烧根。每年变化穴施位置，这样有3~4年就可实现全园土壤改良。
