1、弱光障害在弱光条件下，果实的发育受到抑制，单果重量减轻，空洞果、果腐病果增多。
防止措施
尽可能地改善棚内光照条件。定植时，适当加大株行距，减少株间遮光；保持棚膜清洁，防止膜面附着水滴和尘物；番茄生长中后期，中午前后气温达到15℃时，适当揭开部分棚膜，让阳光直接射入棚内。另据试验，利用聚酯镀铝膜拼成2米宽、3米长的反光幕，挂在塑料大棚(或温室)后立柱上端，下边垂至地面，可使地面增光40～43%，棚温提高3～4℃地温提高1.8～2.9℃，番茄增产41.8～58.1%，并对果实品质有所改善；地面铺设银灰膜或铝箔，也能增加植株间光照强度，使番茄着色良好，并能防止下部叶子片早衰。
2.低温障害
番茄气温低于13℃时不能正常坐果，夜温低于15℃时造成落花落果，气温在10℃或低于10℃时易发生冷害，长时间低于6℃植株将死亡。低温持续时间长，叶片暗绿无光，或顶芽生长点受冻，根系生长受阻或形成畸形花，造成低温落花或果实畸形，果实不易着色或着色浅影响商品价值。
防止措施:低温锻炼
把泡胀后将要发芽的种子放在0℃左右的温度下冷冻1～2天，然后播种，可促进发芽，增强秧苗抗寒性；把将要发芽的种子每天在1～5℃的较低温度下放置12～18小时，接着转移到18～22℃的较高温度下放置6～12小时，如此反复数日，也能显著提高秧苗抗寒力，并能加快其生长发育速度。
②定植前进行低温炼苗，定植时选择晴天，以利根系恢复生长。
③多层覆盖
在塑料大棚内套小拱棚可使小拱棚内的气温比大棚提高2～4℃，低温提高1～2℃；在塑料大棚中采用塑料薄膜做成二层幕，于夜间覆盖，可使棚内气温、地温平均提高1～2℃；在大棚四周覆盖一层1米高的草苫子，亦可使棚温提高1～2℃。
④临时加温临时加温设备要早有准备。不要明火加温，防止一氧化碳中毒。加温设备要有散热性好的较长的烟道，以提高热能利用率。
⑤根据天气预报，于傍晚喷洒27%高脂膜乳剂80～100倍液、巴姆兰丰收液膜250倍液。另外，要注意选择耐低温的品种，如津粉65等。
3.高温障害当白天温度高于35℃，或40℃高温持续4小时，夜间温度高于20℃，就会引起茎叶损伤及果实异常。
防止措施
①通风使叶面温度下降。
②遮光。阳光照射强烈的，可部分遮荫或覆盖遮阳网遮荫。
③喷水降温。
4.筋腐病
筋腐病又叫条腐病、条斑病，是近年来大棚(或温室)番茄发生较为普遍的一种生理病害，感病果实沿着表皮的维管束部分变成褐色，由于延迟着色而使表皮出现绿斑；果实着色时，从外部可以看出内部的褐变。筋腐病发生的原因，主要是施用氮肥过多，尤其是在过量施用铵态氮时，更易发生。另外，棚内光照不足，空气不流通，灌水过多，温度过高，昼夜温差小，或者土壤中钾、硼、钙等营养元素供应不足，都容易诱发筋腐病。
防止措施
合理施肥，防止单一施用大量氮肥；勤中耕、少浇水，保持土壤疏松，含水量适宜，以促进根系发育，适当增加棚内光照，并根据棚内温度变化适时通风换气，防止棚内温度过高。
