1.不良天气造成芒果因为喜阳畏寒，所以一般会种植在温暖的偏南地区。偏南地区在4—5月时天气回暖，日照时间变长。阳光太过强烈，会造成芒果日灼，芒果的肩部易受到日灼伤害，使得芒果的表皮变褐腐烂，失去经济价值。因为芒果畏寒的特性，就算是在南部地区，也会有温度比较低的时刻，所以芒果会经常遇到寒害。广西、云南地区在花期、幼果期容易遇到低温降雨天气，造成黑花、落果，授粉受精不良等。
2.叶缘干枯芒果叶缘焦枯病是一种十分常见的生理性病害，在秋季气候干燥、光照较强的时候，树体吸收的水分，供应不及叶片蒸发掉的水分，造成树体缺水，使叶缘干枯。或是土壤中的盐离子、硼元素浓度过高，硝酸钾、硼肥施用过多，也会引起叶缘枯病。
3.裂果裂果在芒果长到橄榄大小时就开始产生，在芒果的膨大期非常容易出现，芒果的裂果和芒果的品种、生育期、气候、肥水管理等因素都有关系，尤其是肥水管理，干旱的时期，果地骤然降雨或是灌水过多就会容易造成落果。
4.空气污染引起在芒果园附近如建有制砖厂、玻璃厂等工业工厂，工厂排放的废弃等会引起空气污染，造成芒果如黑顶病等生理性疾病的发生，所以在建园时，选地要考虑好环境因素。
