采收芥蓝以食用花薹和嫩叶为主，故要及时采收。采收标准为花序充分发育，花蕾尚未开放，这时花薹长到最大，品质最好。目前芥蓝有两类品种：对于分枝能力强的品种，要多次采收，采收主薹时要在基部留4～5片叶，有利于腋芽发生而形成侧薹，当侧薹也长到17～20厘米左右时便可以采收侧薹。采收侧薹，基部留1～2片叶，以便生长第二级侧薹，如管理得当，侧薹发育好，采收期会延长，产量很高。
芥蓝第一次采收在主薹长至与基叶等高时进行。采收主薹用小刀在基部5～7叶节处斜向下割下。采收节位高，留叶多，则腋芽数多，腋芽所需要的养分不足，所形成的侧花薹细小；如采收节位过低，留叶少，不但影响主薹质量，而且基部腋芽数目减少，产量也低。侧薹长度在15～20厘米时收获。采收时保留1～2片基叶，以保证菜薹质量，也为以后侧薹生长留有一定的营养叶。采收后去掉下部叶片及黄叶、病叶。菜薹连续采收的时间因品种和栽培季节及管理水平不同形而不同。肥水供应充足时，侧薹生长快而健壮。
注意事项：
1、采收时切口要稍倾斜，防止伤口积水腐烂。
2、对于分枝能力弱的品种，要一次采收，采收主薹时要从基部明显膨大处切取。
