氮素可促进番茄茎叶生长，叶色增绿，有利于蛋白质的合成。使番茄营养生长旺盛，有利于花芽分化、发育以及果实膨大。氮肥施用过多或者不当，容易引起植株徒长和落花。营养生长过旺，座果率低，抗病虫能力下降，果实不耐挤压保鲜期短，氮过量果实症状与缺钾相似，可用钾肥纠正氮过量症状。番茄生育期如氮肥过多，不但是植株徒长和落花，并会影响植株根系对钙的吸收引起脐腐病等病害，并发生很多生理障碍。
磷可以促进番茄根系生长，对花芽分化发育的效果明显，并能加速开花和结果，提高产量和品质。番茄对磷的吸收不多，但对磷敏感。缺磷时生长受抑制，果实成熟延迟，含糖量降低，产量也受影响。严重缺磷时，叶背呈紫红色，根系不发达，且有落花现象。
钾能提高番茄的抗病力，促进有机质的运转，使果实着色均匀。同时还能减少落花落果，结果期需钾量增多。钾不足番茄下部叶片叶缘卷曲、黄萎，灰白色斑点，缺钾果实表现为“绿背病”。
