立枯病在春季种子出苗前用70％敌克松500倍液喷洒床面；出苗后用50％多菌灵500倍液进行防治。
菌核病此病多发生在6-7月，发病初期在叶柄基部，呈褐色条形病斑，扩展后地上部倒伏枯死。同时．病菌向根部蔓延．使根茎上布满黑色菌核．以至全根腐烂仅剩根皮。其防治方法是：早春及时松土，提高地温，注意排水；发现病株及时拔除毁掉；用0.3度石硫合剂、代森铵600-800倍液，代森锌600倍液喷洒；适时采收，换地栽培。
锈病干旱时应及时浇水，展叶后喷施50％多菌灵300倍液，7-10天1次，喷施2-3次。
虫害危害细辛的虫害有小地老虎、细辛凤蝶的幼虫、黑毛虫及蝗虫、蚂蚁等，它们咬食细辛的芽苞和叶片，可用敌敌畏、敌百虫、速灭杀丁等药剂防治。
