苹果干枯病主要为害定植不久的幼树，杨凌职业技术学院教授马志峰提醒该病要提早防治，否则将导致幼树树势减弱甚至死亡，影响收益。
危害症状苹果树干枯病主要为害幼树，多在地面以上10～30厘米处发生。春季在上年一年生病梢上形成2—5厘米长的椭圆形病斑，多沿边缘纵向裂开而下陷，与树分离，当病部老化时，边缘向上卷起，致病皮脱落，病斑环绕新梢一周时，出现枝枯，则可致幼树死亡。
防治方法加强栽培管理，园内不与高秆作物间作，冬季涂白，防止冻害及日灼；剪除带病枝条，在分生孢子形成以前清除病枝或病斑，以减少侵染源。刮除病斑，尤其在春季发芽前后要经常检查，刮后应涂药保护。对病重果树，应剪除病枝干，带出果园处理。在分生孢子释放期，每半个月喷洒1次40％多菌灵悬浮剂或36％甲基硫菌灵悬浮剂500倍液、50％甲基硫菌灵？硫磺悬浮剂800倍液、50％混杀硫悬浮剂500倍液。
