小麦黑胚病是一种寄生真菌引起的病害，任何一种不良的环境条件及其他不利因素都会不同程度地诱发该病发生。因此在小麦生产中要高度重视对黑胚病防治工作，提高小麦的产量和质量。
1、种子处理。播种前可选用种子重量0.2%的20%粉锈宁乳油拌种，降低苗期病害发生程度。
2、加强管理。在增施有机肥的基础上，搞好氮、磷、钾与微肥的配合施用，增加土壤透气性，播种时不要播种过深，干旱时要及时浇水。在小麦拔节孕穗期及扬花期每亩用20%粉锈宁乳油75克或12.5%禾果利可湿性粉剂20克对水50千克进行叶面喷雾，可有效地控制该病发展。
3、实行轮作。将小麦与油菜、马铃薯等非禾本科作物实行轮作，深翻土壤将病株残体深埋土中，以消灭病菌。
4、选用抗病品种
