实施水稻工厂化育秧，可以成倍地提高作业效率，是集约化培育壮秧的有效途径。水稻工厂化育秧的主要程序包括播前准备，精量播种，大棚绿化管理三部分。
一、播前准备
1、育秧工厂准备。育秧工厂主要包括播种室、育秧室(大棚绿化室)两个车间。
播种室包括浸种池和播种生产线。浸种消毒处理与常规育秧相同。播种生产线由撒土机、喷水机、播种机、覆土机及传动带组成。播种室的功能是完成浸种、消毒、播种程序。播种使用与播种机相配套的特制塑料硬盘或塑料软盘加托盘，规模为60×33厘米，434孔。
育秧室是大型的连栋塑料大棚，利用自然光温条件保温、保湿并进行秧苗绿化。大棚可采用热镀锌铸铁管为立柱，塑钢复合管为棚架，覆盖无滴薄膜，一侧安装铝合金推拉门，另外三侧分别配备摇膜通风装置。大棚规格因地制宜。一般檐高3-3.5米，脊高4-4.8米，长20-30米，每栋跨度7-9米，五连栋。棚内设多层立体苗架，架子多用空心钢管、角铁搭成，层间距0.5米，每层都装有喷灌设备，架间距为1米。
2、营养土准备。选择有机质含量高，杂草种子少，带有一定黏性的熟土，经培肥、粉碎、过筛制成营养土，每张秧盘备1.4公斤。培肥营养土，一是每300公斤土加50公斤优质人畜粪，堆闷1个月以上再粉碎过筛；二是应用壮秧营养剂，每100公斤营养土拌和1公斤壮秧营养剂。
3、种子准备。种子经精选后，用浸种灵、使百克浸种72小时，捞出晾干后待播，不催芽。
二、精量播种
1、播期播量确定。工厂化育秧棚内温度偏高，秧苗生育进程快，养分来源以及光照条件受到一定限制，秧龄弹性相对较小。长江中下游地区一般把播期定在5月22-23日，秧龄18-20天，秧苗3.5叶期抛栽。坚持精量稀播，每亩大田用种量控制在2.5公斤，每盘播种50克。
2、精量播种。用精量播种机，一次性完成铺土、洒水、播种、盖土四道工序。底土以铺到秧盘孔穴深一半为宜，过多易露种、串根，过少影响出苗。洒水以浸湿底土为宜。平均每孔播3-4粒种子，空穴率小于1%。播后将塑盘送入大棚，摆放到秧架上，在盘面盖上稻草(每张秧盘盖草100克)保湿和防止水滴冲刷形成露籽。
三、大棚绿化管理
1、浇水。出苗阶段必须保持一定的土壤湿度，要求相对含水量达80%以上。由于大棚内温度较高，蒸发量大，往往很难做到早上补水湿润到晚上，尤其是顶层，晴天中午补一次水只能维持两个小时。所以，在盖草的基础上，每天要少量多次补水。顶层蒸发量大，一般要求播后每天补水4次，分别在上午7-8点、11点和下午1点、5-6点进行，保持盘土湿润，阴天每天补水2次，到第四天齐苗时揭去稻草。中下层每天补水2次，分别在上午11点和下午5-6点进行，阴天可以不补水。出苗后以盘土发白，秧苗卷叶为标准，根据需要随时补水。每次补水都要使盘土水分饱和(秧盘开始滴水)，每次补水时间大约3分钟。
2、施肥。1叶1心期喷施"断奶肥"，结合施用多效唑、尿素(1%)、磷酸二氢钾(0.25%)。
3、控温。重点要防止高温危害。工厂化育秧棚内晴天中午最高温度可达41-42℃，对秧苗生长有较大危害。如果采取遮光措施，对降低温度有一定作用，但势必影响采光。为此，降温应采取以下措施：一是通风，把门打开，把棚膜摇起来，以加快空气流通；二是补水，中午通过补水能使温度降低3℃，采取上述措施能使棚内温度不超过35℃。
4、增光。工厂化育秧，光照不足是一个比较突出的问题。为改善光照条件，立体苗架层间距不宜小于50厘米。秧盘在苗架上适当分开来(间距10厘米)对放，改善中下层秧盘的光照条件。2叶期后，上下、里外间定期倒盘，使秧盘受光均匀。
5、通风。通风是工厂化育秧所必需的，一可换气，二可降温调湿，三可炼苗。出苗阶段以闭棚为主，根据需要适当通风。1叶1心至2叶1心期白天通风，夜间闭棚。2叶1心期后全天通风不闭棚，降温炼苗。
6、防病。工厂化育秧由于温度高，要严防恶苗病、青枯病、稻瘟病发生。恶苗病在浸种时用浸种灵和使百克防治。青枯病在2叶1心期、3叶1心期喷施旱秧绿2号防治。稻瘟病在2叶1心期、3叶1心期及抛栽前1-2天用稻病清防治。
