种菇结束后被清理出来的培养料即是下脚料，因为培养料经过平菇菌丝有关酶的分解和转化后，其营养结构发生了较大的变化，加上平菇菌丝的残留，使其中的粗纤维和木质素含量分别下降了50%和30%以上，粗蛋白却增加了1倍以上，因此除了霉烂变质的下脚料用做肥料外，一般的下脚料应进行综合利用，提高其经济价值。用做肥料：下脚料结构疏松，有机质含量高，当肥料施用是最常用的方法，它可以改善土壤团粒结构和提高地力。用做饲料：下脚料干燥粉碎后可制成菌糠，也可直接打浆拌入基础饲料（饼、酒糟、麸皮、青饲料等）中喂养畜禽。使用量：喂鸡时占基础饲料的5%~20%，喂猪时占基础饲料的20%~40%，喂牛时占基础饲料的30%~50%。用于食用菌再生产：生产上进行发酵和无菌处理，再用于草菇、平菇等食用菌栽培，在配方中补充一定量的辅料和新培养料。用做再生能源：以下脚料加猪粪（重量比为1∶1.4）为发酵配料生产沼气，不仅能缩短沼气的发酵周期，而且能提高沼气的产量。
