红薯常见危害较大的病害有黑斑病、茎线虫病、根腐病和瘟病等。感病轻的造成弱苗、缺苗断垅，感病重的减产20%-30%，最严重的减产50%-60%，薯块的质量也受到很大影响。
这些病害的传播途径，一是种薯种苗带病，二是土壤残存的病菌，三是病株残体沤制的肥料，四是田间管理操作不当或者降雨流水时带菌传播。生产上必须采取对应措施早防早治。
首先，选用抗病品种。抗黑斑病、茎线虫病的品种有苏薯1号、福薯87、济南红等。抗根腐病的品种有农大22、徐薯18、苏薯3号等。抗瘟病的品种有广薯62、湘薯75-55、华北48等。
其次，实行轮作、搞好检疫。红薯的感病田块要与水稻、小麦、玉米、大豆等作物轮作3年以上。要建立无病种薯基地，严禁疫区的薯苗到无病区种植。
第三，净化苗床、清除残留病体。每年种薯育苗期间要选好无病土壤作苗床，要做到净种、净土、净肥育苗。要彻底清除病株残体，集中烧毁或者深埋，严防带病传播。
第四，化学药剂防治。对于黑斑病、茎线虫病可用药剂浸种或者浸泡种苗，一可用50%代森铵水剂200-300倍液浸种10分钟，或用50%辛硫磷乳油300倍液，浸薯苗下部半小时后移栽。二可用50%多菌灵可湿性粉剂1000倍液浸种10分钟。三可用50%甲基托布津可湿性粉剂200倍液浸种10分钟。同时，可用50%多菌灵2000-4000倍液，或用50%甲基托布津1000-2000倍液，浸薯苗基部3分钟。
