西甜瓜苗期经常发生各种病害，严重时造成大片死苗，甚至毁苗，延误农时。苗期病害主要有猝倒病、立枯病、根腐病、沤根病等。采取综合防治措施，做好苗期病害的防治，培育无病壮苗是西甜瓜获得优质、高产的基础。具体防治措施如下：
一、农业防治
1、播种育苗。要选择地势较高、背风向阳、地下水位低、排水良好的田块作苗床。选用无病土育苗，堆沤肥要充分腐熟，不可使用带菌的有机肥。
2、加强栽培管理。甜瓜播后、苗前要增温促出苗，出苗后逐步降温，防止徒长。特别要结合天气变化情况，经常通风换气，降低床内的空气湿度，不给病害发生创造适宜条件。尤其在连续阴雨天气，光照不足的情况下，更要抓紧机会通风降湿。苗期浇水不宜过度，避免幼苗徒长。喷施新高脂膜600－800倍液，盖好薄膜防止低温受寒。
二、药剂防治
1、种子处理和苗床消毒：2.5%适乐时SC进行拌种，用量为种子量的0.3-0.4%。用30%苗菌敌20克拌和25-30公斤细土制钵和作盖籽泥。
2、喷药保护：幼苗期开始喷施新高脂膜600－800倍在植物表面，防止病菌侵染，提高抗自然灾害能力，提高光合作用强度，保护禾苗茁壮成长，每10天左右喷1次。发现少量病苗时应及时拔除病株，撒施少量的干土或草木灰去湿，适当通风降湿，及时分苗，局部施药防止病害扩展。药剂防治可选用25%阿米西达SC1500倍液、75%百菌清WP600倍液、75%甲基托布津WP1000倍液、64%杀毒矾WP500倍液或2.5%适乐时SC1500倍液等喷雾防治。每7-10天喷1次，一般1-2次。
