1、主要发病原因是低温高湿、光照不足、播种过密、氮肥施用过多以及苗床土带菌造成。
番茄苗期猝倒病主要分为出苗期猝倒、烂种、苗后猝倒。在苗后侵染主要是小苗生长的前期，主要危害根部和土面上幼苗茎基部，呈现水渍状变褐，茎基部缢缩呈线状，幼苗倒伏，发病速度非常快，幼苗成片死亡。防治可以用喷淋恶甲水剂、精甲霜灵锰锌、普力克来防治。
2、番茄出现沤根情况主要发生在苗期，如果地温长时间低于12度、光照弱、浇水过大都会造成。植株不生新根，而且根系表皮变为锈褐色，根系表皮容易剥离，严重者出现腐烂，从而出现萎蔫或者死棵。地上部叶片发黄，叶缘枯焦，生长极为缓慢。防治方法，苗期浇水要控量，适时喷淋生根剂，促进根系发育；叶面喷施甲壳素、芸薹素等调理剂，增强植株抗性。
