条锈病
条锈病是对我国小麦生产威胁最大的病害，流行年份可减产20％-30％，严重的达50％以上，甚至造成绝产。小麦条锈病主要发生在西南、西北、黄淮和华北等省区，西南四省（市），甘肃陇南、陇中和陇东，陕西南部和关中、湖北西北部和江汉平原为常年重发区，同时对河南、山东、河北等主产高产麦区威胁大。
赤霉病
小麦赤霉病是严重的气候性病害，长江中下游冬麦区为常年流行区，西南地区东部、黄淮海冬麦区和东北三江平原春麦区在穗期多雨年份也易造成严重危害。
小麦赤霉病大流行年病穗率40%-50%，产量损失两成以上；中等流行年病穗率20%-40%，产量损失一成左右。不仅如此，病麦发芽率低、出粉率低、面筋含量减少，品质和利用价值受到严重影响。病麦含有的镰刀菌代谢产物，对人、畜均有毒害作用。
吸浆虫
小麦吸浆虫是一种毁灭性的害虫，一般可造成10%～30%的减产，严重的损失达70%以上甚至绝产。主发区为黄河、淮河流域和华北冬小麦主产区以及甘肃、宁夏、青海等西北高山区。
受吸浆虫为害的小麦，其生长势和穗型大小不受影响，且由于麦粒被吸空，麦秆表现直立不倒，具有假旺盛的长势。受害小麦麦粒浆液被吸食而变瘦，出现瘪粒甚至空壳，造成“千斤的长势，几百斤甚至几十斤产量”的残局，严重时甚至绝收。
蚜虫
小麦蚜虫是我国小麦上发生面积最大、为害最重的害虫，各大麦区均有发生，以江淮、黄淮和华北主产麦区受害最为严重。小麦从出苗到成熟，均有麦蚜为害，其中灌浆、乳熟期是麦蚜发生为害的高峰期，造成籽粒干瘪、千粒重下降，一般年份可使小麦减产5%-20%，大发生年份损失可超过40%以上。
