1、在大田期发病，采用喷雾药剂进行防治，药剂可用：40%富士一号乳剂（需要在发病前施用用较好的预防效果）；或50%多菌灵可湿性粉剂（具有预防有治疗作用，可兼冶纹枯病）；克瘟灵、克瘟唑（要发挥最佳药效，需在病菌侵入之前施用。该药剂能阻止菌丝的入侵和繁殖）；或25%咪鲜胺乳油（对水稻恶苗病、立枯病、条斑病、叶枯病、稻瘟病的防治都很有效。）；或8%噻菌灵（防治叶瘟的施药时间是病害初发前7-10天，防治穗瘟的时间是抽穗前3-4周，能增强叶片内酶的活性，从而提高对病害的抵抗性。）；2%春雷霉素液剂（在发病初期施用效果最好，对已经发病施用也有较好的效果。）；或30%稻瘟灵乳油、或20%三环唑可湿性粉剂、或50%异稻瘟净乳油、或25%咪鲜胺乳油等。
2、科学进行栽培管理，培育壮秧，适当稀插，避免过多、过迟施氮肥，增加有机肥及磷、钾、硅肥用量，合理灌水和晒田，都能增强植株抗病力，减轻和控制稻瘟病的发生和危害。
3、在播种前对种子进行浸种处理，药剂可用：40%多菌灵可湿性粉剂、70%甲基硫菌灵可湿性粉剂、50%稻瘟净乳油、40%异稻瘟净乳油，早稻用1000倍药液浸种48～72小时，晚稻用500倍药液浸种24小时。
4、水稻秧苗2～3叶期发生苗瘟，可用6%施稻灵防治1次。移栽时，用25%使百克乳油1500倍液，或20%三环唑乳油750倍液浸秧根3小时。
