厚皮甜瓜的整枝方式依品种有一定差异，一般多采用双蔓整枝，即在幼苗5叶时摘心，选留两条健壮子蔓。子蔓25叶时摘心。子蔓8节以下和12节以上的孙蔓留1叶摘心，8~11节的4条孙蔓为结瓜蔓，结瓜花前留2叶摘心，每株留瓜2个为好。如果生长势强健的的品种，也可多留1~2个瓜。密植早熟栽培的可进行单蔓整枝。主蔓基部1~5节上着生的子蔓在萌芽时全部抹去，只选留主蔓6~10节上抽生的子蔓坐瓜；对有结瓜花的子蔓留1叶片摘心，对无结瓜花子蔓也在萌芽时抹去。主蔓延伸到20片叶时摘心。每株留1个瓜。总之，不管采用哪种整枝方法，其原则是前紧后松，即坐瓜前，严格整枝、去杈（除萌）、摘心；瓜坐稳后，一般不再整枝摘心，让植株自然生长，以增加叶面积，促进瓜的迅速膨大，达到高产、优质、高效益的目的。
