引起萎蔫症状的还可能是番茄的枯萎病和番茄的茎基腐病。按照目前的气候条件，应该是番茄的茎基腐可能性较大。茎基腐病主要为害番茄的茎基部或地下主侧根。发病初期茎基部皮层产生淡褐色及黑褐色的斑点，病斑扩大，绕茎基部一周，导致茎基部变色并出现皮层腐烂，叶片变黄，植株逐渐萎蔫。后期病部表面长形成黑褐色菌核，剖开茎部，可见木质部也变为暗褐色。叶片枯死不脱落，拔除病株，根系亦不腐烂。此病为立枯丝核菌引起的土传病害。病菌以菌核在病残体上越冬，可以在土壤中腐生2--3年，发病适温24℃，最低13--15℃。
发现病株后可在茎基部施用拌种双药土。具体做法是：用40%的拌种双可湿性粉按照每平米9克的用量与土拌匀制成药土，在病株茎部覆堆，把病部埋住，促进长不定根。也可用40%拌种双悬浮剂800倍液或者20%甲基立枯灵乳油1200倍喷雾，重点是喷洒茎基部，还可以用50%福美双可湿性粉200倍涂抹茎基部。
