大棚甜瓜病害常常使瓜农经济效益降低，为此，应加强综合防治。
一、选用抗病品种。可选用如伊丽沙白、台湾翠香等优良品种。
二、加强肥水管理。一是播种前，定植后要浇足底水，缓苗后浇足缓苗水。生育期如需浇水，应开沟灌小水，覆盖无滴膜；二是增施腐熟的有机肥，三是根外追肥，施用营养元素，如利用糖与尿素混合液每5―7天喷雾一次，可减轻霜霉病的发生；同时用0.2％磷酸二氢钾亦有防病的功效。
三、错开发病时期。甜瓜霜霉病发病温度为22℃―22℃，在栽培中避开这一温度即可避免病害的发生。
四、切断传染源。在田间作业时，尽量避开病、健株的交叉接触，注意及时防治蚜虫，将病残体带出田外。
五、实行轮作、注意间作。栽植甜瓜的棚指尽量不种其他瓜类作物。
六、清洁田园。甜瓜生长期间及时清除杂草，摘除发病的叶片、果实、拔除病株，带出田外深埋或烧毁。甜瓜拉秧后，及时清理残体深埋或烧毁。
七、药剂防治。发病初期应及时防治中心病株，控制病害的发生，使用的农药以生物农药为最好，其次是低毒、低残留农药。如防治细菌性病害应选用72％农用硫酸链霉素水剂4000倍液，14％络酸铜水剂200倍液。防治叶面病害可选用于45％百菌清烟剂，或10％速克灵烟剂熏烟，每亩棚室用药250克，可喷洒的农药有75％百菌清或70％代森锰锌、500―600倍液，、40％乙磷铝200倍液、200倍液的2％农抗拒120，小苏要500倍液等。防治病毒病在发病初期病毒A500倍液或1.5％植病灵水乳剂800―1000倍液、0.5％菇类蛋白多塘水剂300倍液，也可使用银灰塑料膜或黑塑料膜避蚜防病。
八、棚室消毒。在播种或定植前10―15天，每亩棚室用硫磺粉1―1.5公斤，锯末3公斤，分5―6处放在铁片上点燃，或用45％百菌清烟剂250克点燃，关闭棚室。通过采取以上综合措施，可有效防治甜瓜病害，增加瓜农收入。
