一、芹菜枯萎病
发病症状：幼苗感病后，生长缓慢，严重时萎蔫或枯死。成株感病，叶片无光泽，严重时叶片失去绿色或脉间叶肉出现黄绿相间班驳，刨开病茎可见维管束变褐色，根及根茎部，叶柄变为红色，根系腐烂，最后整株枯死。
防治方法：选用抗枯萎病品种。采用高畦或起垄栽培。施用腐熟的有机肥雨后及时排水，严禁大水漫灌。重病地实行3年以上轮作药剂防治：发病初期喷洒91%克萎星可溶性粉剂1000倍液。70%甲基托布菌可湿性粉剂，1000倍液、或50%萎菌净可湿性粉800倍液，灌根每株灌0.5升药液，连续灌2-3次。
二、芹菜根腐病
发病症状：主要为害根部和茎基部。被害处开始长生水侵状红褐色病斑，后变为暗褐色或黑褐色，稍凹陷，叶片变黄，由下往上发展，但叶片不脱落。主根被害腐烂或坏死，侧根少，植株萎蔫枯死，容易拔出。
防治方法：实行轮作，用无病菌土壤育苗或进行床土消毒。
药剂防治：发病初期喷洒80%精碘水剂1000倍液、或50%多菌灵可湿性粉500倍液、或30%绿得宝悬乳剂600倍液，等药剂灌根，每7-10天一次。
三、芹菜灰霉病
发病症状：幼苗期多从根茎部发病，呈水侵状坏死斑，表面密生灰色霉层。成株期发病，多从植株心叶或下部有伤口的叶片发生，初为水侵状，后病部软化，腐烂或萎蔫，病部长出灰色霉层。严重时，芹菜整株腐烂。
防治方法：加强温度、湿管理及通风管理。具体做法为变温管理：即晴天上午晚放风，每次浇水后，进行高温闷棚，当棚温升至33度，再开始放顶风，当棚温降制25度，中午继续放风，使下午棚温保持在20-25度；棚温降至20度，关闭通风口以减缓夜间棚温下降，夜间棚温保持15-17度；阴天打开通风口焕气。浇水易在上午进行，发病初期适当节制浇水，严防过量
药剂防治：发病初期喷洒20%搏容微乳剂1000-2000倍液、或50%利霉康可湿性粉剂1000倍液、或25%或米鲜胺乳油1200倍液、、50%速克灵可湿性粉剂1500倍液，每5-7天一次，连续喷洒2-3次。
四、芹菜黑腐病
发病症状：主要为害根茎部和叶柄基部，多在近地面处染病，有时也侵染根。染病后受害部位先变为灰褐色，扩展后边为暗绿色至黑褐色，初期病部表皮完好，后期破裂露出皮下染病组织，尤以根冠部位易腐烂，叶下垂，呈枯委状，腐烂处很少向上或向下扩展，病部生出许多小黑点，即病原菌的分生孢子器。
严重的外叶腐烂脱落防治方法：选用抗病品种。实行2-3年轮作。采用高畦栽培，开好排水沟，避免畦沟积水。采用遮阳网覆盖。药剂防治；发病初期喷洒54%冠菌铜干悬浮剂1000倍液、或30%绿得宝悬浮剂400倍液、或56%氧化亚铜水分散颗粒剂800倍液，每7-10天一次，连续喷洒2-3次。
