日光温室番茄生长过程中主要的病害有叶霉病、灰霉病、晚疫病、枯萎病等，菜农应注意防治。
一、叶霉病
症状：该病主要危害番茄叶片，初生轮廓不明显的浅黄色褪绿斑，病斑背面灰白色，其上密生边缘灰白色，中部灰黄色至褐色绒状霉，严重的病叶由下向上卷曲，并枯死，病菌也可以侵染茎、花和果实。
防治方法：育苗地与番茄生产地适当隔离，防止苗期感染；加强通风排湿，减少夜间结露；发病初期用75%百菌清粉剂600倍液或70%代森锰锌可湿性粉剂500倍液喷药防治，交替用药，7天1次，连续用药3-4次。
二、灰霉病
症状：该病危害番茄茎、叶和果实，果实发病果皮初呈灰白色，潮湿时病部长出绒状灰绿至灰褐色霉层。果实失水后僵化。叶片病斑黄褐色，中部有轮纹，病叶下垂干枯，潮湿时病斑上产生褐色霉状物。防治方法：注意通风换气；浇水前一天打药，浇后加大放风量；开花前彻底清理病叶，开花后及时摘除病果，携带到棚外掩埋；第一穗果开花前，用45%百菌清烟剂熏烟，亩用量300-400克。
三、晚疫病
症状：叶片产生黑褐色水浸状病斑，然后向茎部扩展，使幼苗萎蔫。成株叶片发病，多从叶尖、叶缘开始。
防治方法：发现病株及时清除病叶、病果或拔除处理；用75%百菌清600倍液或72.2%普力克800倍液喷雾防治。
四、枯萎病
症状：结果以后发病，危害番茄根、茎、叶，开始茎一侧叶片变黄，最后全株枯黄。
防治方法：结果后期增加通风量，降低土壤湿度；在定植时或定植后和预期病害常发期前，将青枯立克按600倍液稀释，进行灌根，每7天用药1次，用药次数视病情而定。
