病原菌为瓜类尾孢，属半知菌亚门真菌。
甜瓜斑点病主要危害叶片，多在开花结瓜期发病。叶片正、背面初生褪绿、黄色小斑点，后扩大为近圆形或不规则形小病斑，直径为0.5～5毫米，边缘深褐色，中部灰白色，微具轮纹，周围有黄色晕环，后期病斑中心常穿孔。
