夏秋季气温高，可以利用营养土沤堆发酵产生的50度以上高温消毒，冬春季则用实用方便的电热温床和杀虫杀菌剂消毒。电热温床上铺上营养土，营养土内温度60度（要达到60度，电热线需加密铺设）保持几个小时即可杀死大部分病虫。
杀虫剂选择在土壤中分解慢持效长且毒性不高的种类，可用辛硫磷或氯吡硫磷，1立方米营养土加入50%辛硫磷或47%氯吡硫磷60克；禁止加入克百威、丁硫克百威、甲拌磷等，虽然这些农药在土壤中的持效期较长，但毒性高。
杀菌剂用广谱杀菌剂，多菌灵价廉实用，1立方米营养土加入50%的多菌灵80克；也可加入石灰氮（使用时注意石灰氮是碱性）、氯化苦（易挥发，在营养土上盖塑膜几天熏蒸）等，禁止加入高残留、致畸的五氯硝基苯、五氯酚钠等。