柚类黑斑病是一种早期（幼果期）浸染、后期（近成熟期）表现症状的病害。潜育期较长，主要为害果实，也可为害叶片和枝梢。一般病菌在谢花后一个半月内侵入幼果，在7月底至8月初才开始出现病状，前期发病容易被人们所忽视而错过了防治时机，往往等到病状完全显现时才喷药，但为时已晚。黑斑病的防治应抓住以关键适期用药为主，加强栽培管理为辅的综合防治措施。
防治最佳时间是谢花后一个半月内和8月份前后。谢花后一个半月内和8月份前后进行喷药保护，间隔10-15天一次，连用2-3次。春雨、台风雨早且多，则发病偏早偏重，反之则发病较晚较轻。可选用90％大生M-45可湿性粉剂600倍液，50％甲基托布津可湿性粉剂500-600倍液，50％多菌灵可湿性粉剂800倍液，50％代森铵1000倍液，45％晶体石硫合剂300-400倍液，0.5∶1∶100波尔多液等。注意适时轮换用药，避免病菌产生抗药性。另据日本报道，多氧霉素和敌菌丹对黑斑病有很好的疗效。应用喷雾器均匀全面喷布药液。
另外冬春季做好清园工作，结合修剪，清除果园内落叶、残枝、病果，集中烧毁，或结合深翻施肥，把表土落叶等混合石灰埋入深处，减少病原菌。管理上注意增施有机肥，注意氮、磷、钾的合理搭配，促进树势健壮，提高柚树的抗病能力，这对老弱果园尤其重要。同时，注意采果时不要损伤果皮，以减轻贮运期发病。
