棚内消毒要彻底蔬菜拔园后，菜农为使下茬蔬菜早日上市，大都在拔园后仓促定植，而忽视了大棚的消毒工作，为下茬蔬菜病害暴发埋下了隐患。蔬菜换茬时，一定把棚内的枯枝残叶清理干净，并认真做好棚内消毒工作。可在蔬菜拔园后，每亩用硫黄粉1000克加锯末混合，拌匀后分放在棚室各点，将所用农具架杆等一并放入棚室，暗火点燃后密闭棚室熏蒸12小时；也可每亩用45%百菌清烟剂400-600克熏蒸，熏蒸时需密闭棚室2天消毒灭菌，定植前1-2天打开通风口通风。棚内的土壤也要进行消毒，可用30%苯噻氰1000倍液或95%恶霉灵水剂450倍液喷湿地面，然后定植蔬菜，效果较好。有地下害虫的大棚，可在定植前穴施适量的杀虫剂，以防地下害虫危害。
土壤要深翻
不少菜农由于仓促换茬，没有对棚地全面翻耕，而只是对蔬菜种植畦进行了耕翻，这是不提倡的。最好人工深翻一遍，或使用旋耕机对棚地全面翻耕。
基肥要充分腐熟
冬季气温低，鸡粪堆积在棚外往往发酵不彻底。而深冬期棚室为保温又相对密闭，若施用了未充分腐熟的鸡粪，很容易造成氨等有害气体在棚内积聚，从而熏坏蔬菜。因此，换茬后在施基肥时，一定要注意察看鸡粪是否已充分腐熟。外观为黄褐色、有臭味的为未充分腐熟的鸡粪，一定要避免施用。
蔬菜定植前要提温暖地
深冬期地温较低，不利于蔬菜幼苗定植后扎根，低温下湿度过大还会引发沤根。因此，定植前两天一定要密闭大棚放风口，提温暖地，使蔬菜定植后尽快扎新根，早发苗。
