到目前为止，还没有特效药可以防治火龙果溃疡病。火龙果溃疡病一旦发生，在发病前期，喷施甲基托布津/多菌灵/代森锰锌等广谱杀菌剂+铜制剂，虽然不能达到治疗效果，但能一定程度抑制火龙果溃疡病蔓延加剧。农业生产上预防措施如下：
1、选择沙质土壤。火龙果果园选址前，应尽量选择沙质土壤建园，尽可能让土壤保持较少的含水量。土壤水分过多，会导致火龙果抵抗力下降。
2、选择抗性较高的品种。目前没有对溃疡病高抗的火龙果品种。相对而言，白肉火龙果较红肉火龙果抗性高，可适量种植白肉火龙果。但红肉火龙果品质较高，单价也高，果农偏向种植红肉火龙果，也是导致火龙果溃疡病发生越来越频繁的原因之一。
3、加强农业防治，施有机肥。施肥应以有机肥为主，视土壤肥力条件施用钙肥、钾肥等，可以增加火龙果茎秆蜡质层厚度，提高抗性。
