1、忌出池后立即施用。沼肥还原性强，出池后立即施用时，它会与作物争夺土壤中的氧气，影响种子和根系发育，导致作物叶片发黄、凋萎。因此，沼肥出池后，一般先在储粪池中存放5--7天后再施用。2、忌不兑水直接追施。沼肥不兑水直接施在作物上，优其是用来追施幼苗的，会使作物出现灼伤现象。因此，沼肥作追肥时要先兑水，一般兑水量为沼液的50%。
3、忌表土撒施。沼肥施于旱地时，宜采用穴施、沟施，然后盖土。
4、忌过量施用。施用沼肥的量不能太大，一般要比施用普通猪粪少。若盲目大量施用，会导致作物徒长。
5、忌与草木灰、石灰等碱性肥料混施。草木灰、石灰等碱性肥料，与沼肥混合，会造成氮肥损失，降低肥效。
