1、适宜的还田量和周期。秸秆还田量既要能够维持和逐步提高土壤有机质含量，又要适可而止，以本田秸秆还田为宜。为避免田块在同一点面上秸秆重复还田，要每隔一年，埋草的墒沟均顺次移动20-25厘米，保证4-5年完成一个秸秆还田周期。
2、适宜的填草和覆土时间。墒沟埋草还田要尽量做到边收割边耕埋。刚刚收获的秸秆含水较多，及时耕埋有利腐解。墒沟填放秸秆后，要及时镇压覆土，以消除秸秆造成的土壤架空。
3、埋草深度和旋耕深度。麦秸填埋深度20厘米左右对苗期生长影响不大。开沟机开沟深度20-25厘米，旋耕机耕深7-10厘米，完全能满足小麦秸秆沟埋的需要。
4、合理施用氮肥。微生物在分解作物秸秆时，需要吸收一定的氮营养自身，造成微生物与作物争氮，影响苗期生长，加之农田自身缺氮，所以机械化墒沟埋草还田时一定要补充氮肥。一般每100公斤秸秆掺入1公斤左右的纯氮。
5、调控土壤水分。为避免秸秆腐烂过程中产生过多的有机酸，应浅水勤灌，干湿交替，在保持土壤湿润的条件下，力争改善土壤通气状况。
