西瓜枝蔓生长旺盛，分枝力也强，所以在西瓜伸蔓期必须要整枝。这样既可以使植株间通风良好，增加光照，调节植株生长，又可以减少病虫害，促进早坐瓜。整枝留蔓的数量应该根据所选择的品种、定植密度、气候条件及土壤肥力来定，生产中常用的有单蔓整枝，双蔓整枝及三蔓整枝三种方法。
单蔓整枝的植株雌花少。坐果部位选留的余地很有限，一般只有大棚栽培或制种田采取单蔓整枝，其它西瓜田很少采用。
双蔓整枝有二种方法：一种是除主蔓外，在植株基部5—8节处选留一处生长健壮的侧蔓，主蔓上其余侧蔓全部除去，主蔓和侧蔓的距离为30—40厘米。双蔓整枝的植株叶片和雌花较多，坐果率较高；另一种方法是主蔓摘心后，选留植株基部两条强壮侧蔓平行生长，其余蔓全部去除。双蔓整枝在早熟西瓜品种中应用较多。
所谓三蔓整枝是在保留主蔓的基础上，再选留二条粗粒的侧蔓，其它侧枝立即摘除。多余的侧蔓不管理多么健壮，不该留的及早摘除，否则不但消耗营养，还影响坐瓜和瓜苗长势。
