火龙果茎腐病、灰霉病在初病时，嫩茎出现黄色斑点。如果病情发展后出现茎腐烂，湿度大时在病部出现黑褐色霉状物的，则是茎腐病。如果病情发展后病斑出现灰色的霉层，则是灰霉病。上述两种病害均为真菌性病害。
茎腐病初发生时，可用25%乡村多菌灵可湿性粉剂250倍液，或70%乡村甲基硫菌灵可湿性粉剂800倍液涂病斑；灰霉病发初发病害时，可用80%代森锰锌可湿性粉剂500倍液，或62%嘧环胺·咯菌腈水分散剂1500倍液，或5%亚胺唑可湿性粉剂800倍液喷雾。上述杀菌剂一般每隔10天喷1次，交替用药效果更理想。
此外，根据照片观察，果实中具有黑褐色有轮纹的病斑为碳疽病病斑，上述的杀菌剂都能防治。
