番荔枝果树是否缺肥，不能只从叶片小而定论。但可以说，如果番荔枝生长不正常，迟迟不抽新梢，或抽出的新梢叶片比正常小或少，这基本是根系生长不良之故。而根系生长不良，与土壤的含水量、土壤的酸碱度、土壤中的有机质过少、幼苗定植时过于粗放根系与泥土出现空洞影响根系生长、有吃根类害虫为害、病虫为害、施肥过少或肥料的结构不合理造成营养不良、施肥量过大造成伤根等等的因素有关。
由于番荔枝的根系浅生，且好气性，番荔枝果树忌土壤积水。因此，种植番荔枝的土壤，地下水位不能过高，地下水位距地面要达80厘米以上。另一方面，由于番荔枝根系较浅生，树盘土壤要用稻草等秸秆等进行覆盖，以减少夏季阳光直射土壤产生的高温对根系的影响。土壤的酸碱度，是以pH值5.5-6.5为宜，即土壤呈微酸性。如果土壤的酸碱度低于或高于上述的数值，很大程度上影响根系的生长。如果土壤的有机质过少，则土壤的保水保肥能力差，土壤的透气性也差，植后即使经常施入化学肥料，这只能加快土壤理化性能的下降，即土壤越来越板结，根系常处于窒息的状态，这必然影响根系的生长和发展。
定植时，由于操作过于粗放，根系与植坑壁出现有空隙或形形成空洞，则根系难以横向即水平生长。对于荔枝的施肥，幼龄树施肥以勤施薄施为原则，一般每培养一次新梢施肥2次，分别于新梢萌芽期及新梢长至约30-40厘米时各施肥一次，肥料以氮素为主，可在每10公斤的稀粪水肥中，加入30克尿素，在树冠滴水线下每株淋约2-3公斤，然后在以后逐步增加。
