甜瓜蔓枯病主要为害茎蔓，也为害叶片和叶柄。露地种植通常夏秋季发病较重，保护地生产一般多年重茬生产棚室发病多，以春秋两季病害严重，常引起死秧。种植过密，通风不好，缺肥或偏施氮肥，保护地浇水后长时间闭棚，容易诱发此病。连作或平畦种植亦有利于发病。在甜瓜生长期高温潮湿多雨，或长时间阴雨寡照，甜瓜生长衰弱，病害常发生较重。
防治方法：
1、实行2-3年与非瓜类作物轮作。每茬作物拉秧后彻底清除瓜类作物的枯枝落叶及残体，集中高温堆沤发酵，杀灭病菌。
2、可用52-55℃温水浸种20-30分钟后催芽播种。也可用种子重量0.3%的50%扑海因可湿性粉剂拌种。
3、适当降低种植密度。
4、施用充分腐熟的有机肥，适当增施磷肥和钾肥，生长中后期注意适时追肥，避免脱肥。
5、发病后加强管理，保护地注意通风。
6、发病初期，选用70%甲基托布津可湿性粉剂600倍液，或40%福星乳油6000倍液，或10%世高水分散粒剂6000倍液或30%特富灵可湿性粉剂3000倍液，或50%扑海因可湿性粉剂800倍液，或43%菌力克悬浮剂5000倍液，或40%多硫悬浮剂500倍液，或2%武夷菌素水剂200倍液，或2%农抗120水剂200倍液，重点喷洒植株中下部。