棉花苗期叶病主要发生在子叶和真叶上，常见的有黑斑病、茎枯病、角斑病和枯萎病。
1.黑斑病:又称轮纹斑病，病苗子叶上出现很多褐色小圆斑，病斑周围有紫红色晕圈，病斑近圆形或不不规则形，背部凹陷，引起子叶干裂破碎。浸染叶柄时出现褐色病斑，围绕叶柄发展，形成环状斑，致使叶片脱落。
2.茎枯病:是一种偶发性但可引起严重减产的病害。受害叶片上病斑呈淡褐色，近圆形，边缘紫红色，斑内可见一些小黑点。嫩茎及叶柄受害形成褐色梭形溃疡斑，中央凹陷，可引起嫩稍枯死，叶柄及叶片脱落。
3.角斑病:是细菌性病害，发生在子叶、真叶及嫩茎上，首先出现深绿色小斑点，逐渐扩大呈水渍状病斑，后变黑褐色，在真叶上，因受叶脉限制而呈多角形，有时病斑沿叶脉发展呈长条弯曲状。子叶上病斑沿叶柄发展可侵染到子叶节。嫩茎上的病斑呈黑绿色，发展成黑褐色条。
4.枯萎病:从子叶期即可发生，定苗前后达到高峰。病苗叶片上出现褪色斑，斑内叶脉变黄，呈黄色网状纹，也有子叶变紫红色，出现紫色网状纹。也有叶边缘变黄，慢慢枯干，病苗根茎外表无症状，但茎内的木质部呈褐色条纹，最后病苗萎蔫枯死。
